一是科学规划，合理布局。严格落实《邹城市畜禽养殖布局规划》，根据规划科学合理安排养殖场分布。控制养殖规模，优化整合畜禽分散饲养场（点），建设标准养殖小区。严把审批关，从源头上控制新污染源产生。新建、改建、扩建畜禽养殖场必须实行“三同时”制度，投入使用前应报环保局，环保局共同对污染防治设施进行预先验收。
二是加强畜禽排泄物污染的控制。采取多种对策对畜禽排泄物的污染进行控制：一是采用多种技术对畜禽粪便进行处理，这样，可提高畜禽粪便作为农业肥料的利用效率，并可杀灭病原菌。既增加了养殖业的收入，又减少了农业污染。二是降低饲料中的矿物质及粗蛋白含量，以达到降低粪便中的氮和矿物质含量的目的。制订有关法规，限制某些抗生素及药物的滥用。三是充分考虑不同地区自然、生态和社会等条件的差异，制订畜禽粪便管理政策，控制粪便的产生、播撒和处置。四是采取收排污费的方式，能有效地减少粪便不恰当处理和贮存给农业造成的污染。
三是突出重点，狠抓沼气池建设。根据实际，鼓励养殖场建设相应大小的沼气池，采用粪尿干湿分离后分开处理。
四是不断创新机制，努力探索良性循环的生态农业新格局。要认真总结现有成功的各类沼气技术和模式，不断创新机制，进一步提高应用水平，努力探索沼气工程良性循环治污的新格局。在治污的同时，要积极开发利用沼液、沼渣用作茶园、竹园、果园、粮田的有机肥料，生产无公害农产品，提高综合利用率，建立生态型畜牧场或“综合农业”系统，充分利用当地的自然资源，利用动物、植物、微生物之间的相互依存关系和现代技术，实行无废物和无污染生产。
五是采取动物营养性环保措施。鼓励养殖场，合理配制饲料。准确测定畜禽营养需要量和饲料原料的营养价值，准确地配制出符合不同生产阶段和目的的畜禽饲料，以减少养分的过度供给并降低养分的排泄量，避免对环境造成污染。积极和高校院所合作，加强环保型饲料和生物饲料的研究应用，同时消除饲料中抗营养因子的抗营养作用，提高饲料养分的利用率，减少氮和磷的排出量。
六是加强畜禽污染的宣传教育。要大力宣传畜禽污染的严重性，提高畜禽养殖场从业人员的环境意识和管理水平，要引导畜禽养殖场走农牧结合的道路，对畜禽粪便进行综合治理，防止任意排污现象的发生。